Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp1Q6A037 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
N4bp1Q6A037 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4bp1Q6A037 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4bp1Q6A037 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms