Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms