Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rapgefl1Q68EF8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgefl1Q68EF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgefl1Q68EF8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rapgefl1Q68EF8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rapgefl1Q68EF8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rapgefl1Q68EF8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgefl1Q68EF8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rapgefl1Q68EF8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms