Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BegainQ68EF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BegainQ68EF6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BegainQ68EF6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BegainQ68EF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BegainQ68EF6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BegainQ68EF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BegainQ68EF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms