Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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BC080695Q66JY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC080695Q66JY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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BC080695Q66JY9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC080695Q66JY9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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BC080695Q66JY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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BC080695Q66JY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC080695Q66JY9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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BC080695Q66JY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC080695Q66JY9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms