Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8eQ66JT1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8eQ66JT1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8eQ66JT1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8eQ66JT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms