Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Npdc1Q64322 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npdc1Q64322 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Npdc1Q64322 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Npdc1Q64322 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms