Protein–RNA interactions for Protein: Q64267

Xpa, DNA repair protein complementing XP-A cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpaQ64267 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpaQ64267 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XpaQ64267 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpaQ64267 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpaQ64267 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpaQ64267 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XpaQ64267 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpaQ64267 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpaQ64267 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpaQ64267 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms