Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab34Q64008 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab34Q64008 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab34Q64008 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab34Q64008 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab34Q64008 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab34Q64008 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms