Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CcncQ62447 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcncQ62447 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcncQ62447 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcncQ62447 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcncQ62447 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcncQ62447 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcncQ62447 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcncQ62447 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcncQ62447 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcncQ62447 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcncQ62447 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcncQ62447 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CcncQ62447 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CcncQ62447 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcncQ62447 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcncQ62447 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 940.4 ms