Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TfrcQ62351 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TfrcQ62351 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TfrcQ62351 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TfrcQ62351 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TfrcQ62351 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TfrcQ62351 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms