Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3bQ62177 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3bQ62177 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sema3bQ62177 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema3bQ62177 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3bQ62177 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms