Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RhocQ62159 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RhocQ62159 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RhocQ62159 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RhocQ62159 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RhocQ62159 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RhocQ62159 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RhocQ62159 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RhocQ62159 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RhocQ62159 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RhocQ62159 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RhocQ62159 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RhocQ62159 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms