Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkd1Q62101 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkd1Q62101 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkd1Q62101 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkd1Q62101 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkd1Q62101 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms