Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mrc1Q61830 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mrc1Q61830 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mrc1Q61830 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mrc1Q61830 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mrc1Q61830 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrc1Q61830 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mrc1Q61830 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mrc1Q61830 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms