Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pacsin1Q61644 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacsin1Q61644 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacsin1Q61644 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pacsin1Q61644 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms