Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifi47Q61635 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifi47Q61635 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifi47Q61635 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi47Q61635 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi47Q61635 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi47Q61635 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms