Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik5Q61626 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grik5Q61626 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grik5Q61626 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Grik5Q61626 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Grik5Q61626 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Grik5Q61626 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms