Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pafah1b2Q61206 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pafah1b2Q61206 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pafah1b2Q61206 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms