Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc1Q61056 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc1Q61056 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc1Q61056 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc1Q61056 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms