Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SkiQ60698 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SkiQ60698 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SkiQ60698 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SkiQ60698 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SkiQ60698 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SkiQ60698 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SkiQ60698 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SkiQ60698 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SkiQ60698 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SkiQ60698 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SkiQ60698 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SkiQ60698 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SkiQ60698 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SkiQ60698 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SkiQ60698 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SkiQ60698 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SkiQ60698 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SkiQ60698 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms