Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sin3aQ60520 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sin3aQ60520 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Sin3aQ60520 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Sin3aQ60520 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sin3aQ60520 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms