Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a6Q5U4D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc5a6Q5U4D8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc5a6Q5U4D8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms