Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rabl6Q5U3K5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rabl6Q5U3K5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rabl6Q5U3K5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl6Q5U3K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms