Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NotoQ5TIS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NotoQ5TIS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NotoQ5TIS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NotoQ5TIS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NotoQ5TIS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms