Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV42

Serpinb1c, Leukocyte elastase inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb1cQ5SV42 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpinb1cQ5SV42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpinb1cQ5SV42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Serpinb1cQ5SV42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serpinb1cQ5SV42 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serpinb1cQ5SV42 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms