Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm11992Q5SS90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11992Q5SS90 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm11992Q5SS90 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11992Q5SS90 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm11992Q5SS90 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms