Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv4Q5R1A3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trdv4Q5R1A3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trdv4Q5R1A3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trdv4Q5R1A3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trdv4Q5R1A3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms