Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1810065E05RikQ5NC41 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
1810065E05RikQ5NC41 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1810065E05RikQ5NC41 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
1810065E05RikQ5NC41 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
1810065E05RikQ5NC41 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
1810065E05RikQ5NC41 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms