Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xaf1Q5NBU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Xaf1Q5NBU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xaf1Q5NBU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xaf1Q5NBU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xaf1Q5NBU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms