Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo39Q5NBU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo39Q5NBU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo39Q5NBU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo39Q5NBU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo39Q5NBU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms