Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpdyaQ5IBH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpdyaQ5IBH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpdyaQ5IBH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpdyaQ5IBH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpdyaQ5IBH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpdyaQ5IBH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms