Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h12aQ5D1E7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h12aQ5D1E7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12aQ5D1E7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12aQ5D1E7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12aQ5D1E7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12aQ5D1E7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms