Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eri2Q5BKS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eri2Q5BKS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eri2Q5BKS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eri2Q5BKS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eri2Q5BKS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eri2Q5BKS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms