Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp13Q5BKP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp13Q5BKP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp13Q5BKP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms