Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne3Q4FZC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syne3Q4FZC9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syne3Q4FZC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Syne3Q4FZC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syne3Q4FZC9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syne3Q4FZC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms