Protein–RNA interactions for Protein: Q497L3

Gm5800, Predicted gene 5800, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5800Q497L3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5800Q497L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5800Q497L3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5800Q497L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5800Q497L3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5800Q497L3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5800Q497L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5800Q497L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5800Q497L3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5800Q497L3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5800Q497L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms