Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil2Q3V3V9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Carmil2Q3V3V9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Carmil2Q3V3V9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil2Q3V3V9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms