Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc55Q3UY51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc55Q3UY51 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc55Q3UY51 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc55Q3UY51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc55Q3UY51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc55Q3UY51 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc55Q3UY51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc55Q3UY51 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc55Q3UY51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc55Q3UY51 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms