Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E330034G19RikQ3UWX6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E330034G19RikQ3UWX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms