Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm428Q3UTE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm428Q3UTE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm428Q3UTE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm428Q3UTE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm428Q3UTE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm428Q3UTE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms