Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Obox3Q3UT54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Obox3Q3UT54 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Obox3Q3UT54 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Obox3Q3UT54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Obox3Q3UT54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms