Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28047Q3US59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm28047Q3US59 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28047Q3US59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm28047Q3US59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28047Q3US59 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28047Q3US59 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms