Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkain3Q3URJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain3Q3URJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkain3Q3URJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkain3Q3URJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms