Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b2Q3UR50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b2Q3UR50 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b2Q3UR50 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b2Q3UR50 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b2Q3UR50 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwa5b2Q3UR50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa5b2Q3UR50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa5b2Q3UR50 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa5b2Q3UR50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms