Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms