Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog7Q3UM29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cog7Q3UM29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cog7Q3UM29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cog7Q3UM29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms