Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms