Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ell2Q3UKU1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ell2Q3UKU1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ell2Q3UKU1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ell2Q3UKU1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ell2Q3UKU1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms