Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trafd1Q3UDK1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trafd1Q3UDK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trafd1Q3UDK1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trafd1Q3UDK1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms